MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Periplaneta americana) str. BPLAN plasmid pBPLAN

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013419	CAG	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261599113
2	NC_013419	ATA	2	6	625	630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599113
3	NC_013419	GAG	2	6	779	784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261599113
4	NC_013419	TAAT	2	8	800	807	50 %	50 %	0 %	0 %	261599113
5	NC_013419	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	261599113
6	NC_013419	ATA	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599113
7	NC_013419	GAATG	2	10	883	892	40 %	20 %	40 %	0 %	261599113
8	NC_013419	AAAATA	2	12	926	937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261599114
9	NC_013419	AT	3	6	948	953	50 %	50 %	0 %	0 %	261599114
10	NC_013419	TA	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	261599114
11	NC_013419	ATTTT	2	10	971	980	20 %	80 %	0 %	0 %	261599114
12	NC_013419	CATT	2	8	998	1005	25 %	50 %	0 %	25 %	261599114
13	NC_013419	T	6	6	1032	1037	0 %	100 %	0 %	0 %	261599114
14	NC_013419	ATA	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
15	NC_013419	CCT	2	6	1083	1088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261599114
16	NC_013419	T	10	10	1100	1109	0 %	100 %	0 %	0 %	261599114
17	NC_013419	ATCATA	2	12	1141	1152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261599114
18	NC_013419	AAT	2	6	1209	1214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
19	NC_013419	AACTA	2	10	1216	1225	60 %	20 %	0 %	20 %	261599114
20	NC_013419	CAA	2	6	1252	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599114
21	NC_013419	AT	3	6	1283	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	261599114
22	NC_013419	A	8	8	1300	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	261599114
23	NC_013419	TTA	2	6	1316	1321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599114
24	NC_013419	ACA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599114
25	NC_013419	ATA	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
26	NC_013419	TTA	3	9	1389	1397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
27	NC_013419	TAT	2	6	1423	1428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
28	NC_013419	AACA	2	8	1450	1457	75 %	0 %	0 %	25 %	261599115
29	NC_013419	TTA	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
30	NC_013419	TTG	2	6	1562	1567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261599115
31	NC_013419	AT	3	6	1582	1587	50 %	50 %	0 %	0 %	261599115
32	NC_013419	TCA	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599115
33	NC_013419	CA	4	8	1705	1712	50 %	0 %	0 %	50 %	261599115
34	NC_013419	TTCC	2	8	1730	1737	0 %	50 %	0 %	50 %	261599115
35	NC_013419	A	8	8	1769	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	261599115
36	NC_013419	CTCCAT	2	12	1794	1805	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	261599115
37	NC_013419	T	6	6	1862	1867	0 %	100 %	0 %	0 %	261599112
38	NC_013419	T	9	9	1884	1892	0 %	100 %	0 %	0 %	261599112
39	NC_013419	GAA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261599112
40	NC_013419	A	7	7	1978	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
41	NC_013419	TCTG	2	8	1985	1992	0 %	50 %	25 %	25 %	261599112
42	NC_013419	A	7	7	2065	2071	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
43	NC_013419	CT	4	8	2125	2132	0 %	50 %	0 %	50 %	261599112
44	NC_013419	T	6	6	2186	2191	0 %	100 %	0 %	0 %	261599112
45	NC_013419	TTTC	2	8	2232	2239	0 %	75 %	0 %	25 %	261599112
46	NC_013419	A	6	6	2316	2321	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
47	NC_013419	AAAG	2	8	2363	2370	75 %	0 %	25 %	0 %	261599112
48	NC_013419	AGA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261599112
49	NC_013419	AAC	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599112
50	NC_013419	GCT	3	9	2408	2416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261599112
51	NC_013419	CTT	2	6	2432	2437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261599112
52	NC_013419	TAT	2	6	2451	2456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599112
53	NC_013419	CATC	2	8	2481	2488	25 %	25 %	0 %	50 %	261599112
54	NC_013419	CAT	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599112
55	NC_013419	A	6	6	2525	2530	100 %	0 %	0 %	0 %	261599112
56	NC_013419	GCT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261599112
57	NC_013419	CAT	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599112
58	NC_013419	AAT	2	6	2667	2672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599112
59	NC_013419	TTCTGT	2	12	2680	2691	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261599112
60	NC_013419	AT	3	6	2709	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	261599112
61	NC_013419	ATTT	2	8	2779	2786	25 %	75 %	0 %	0 %	261599112
62	NC_013419	TTG	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261599112

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.